Num estado normal, numa flora de fermentação, protectora cobre as paredes do intestino e opõem-se a proliferação das bactérias patogénicas assim como ao desenvolvimento da flora de putrefacção que, quando se encontra em excesso, passa a ser irritante para o cólon e gera compostos tóxicos para o fígado.
Os desiquilibrios da flora intestinal, os transtornos digestivos e hepáticos constituem os sinais caracteristicos do terreno baso-colitico putrefacto. Diariamente estas disfunções traduzem-se em digestões lentas ou dificeis, sensações de ventre inchado e transtornos do transito (acelerado ou difícil), podendo chegar a obstipação.
Nalguns casos a destruição da flora intestinal pode favorecer o desenvolvimento de fungos ou bactérias patogenáticas.
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